武汉科技职业学院的管理体系实行董事会领导下的院长负责制，这一制度下，学院的决策和管理由院长、党委书记、常务副院长、副院长以及院长助理等高级管理人员共同负责。
学院内部设有多个职能机构，以支持教学和管理的高效运行。其中包括院办公室（包括文明建设办公室），负责处理日常行政事务；教务处负责教学计划和课程管理；招生与就业指导处负责学生的入学和职业规划；学生工作处（包含安全保卫部门），关注学生的成长与校园安全；宣传处（或部）负责学院的对外宣传；人事处负责人力资源管理；财务处负责学院的财务工作；后勤处（含资产管理）保障设施运行；实验中心（含职业技能培训与鉴定）提供实践教学支持；教学督导室确保教学质量；图书馆（含教育信息中心）是知识学习的中心；民办高等职业教育研究所则进行职业教育研究和创新。
在党群方面，学院设有院党委办公室，负责党的工作和思想引领；工会关注教职工的权益与福利；团委则负责青年学生的团建活动和思想教育工作。
武汉科技职业学院是2002年经湖北省人民政府批准，国家教育部备案成立的一所民办普通高等职业学院。学院始建于1984年，经过20余年的建设与发展，学院已经成为一所以电子信息应用技术为主，工、经、管、文等专业协调发展，初具办学特色，享有良好社会声誉的高等职业学院。