流域内建有大型灵东水库1座，小（一）型有牛皮鞑、桐油塘、龙塘等水库12座，小（二）型有黄茅、大田坡水库等37座，以及众多的小型山塘水库，这些山塘水库共控制集雨面积221.5平方公里，占流域总面积的21.2%，总库容2.3亿立方米，占流域年径流量的24.3%。
灵东水库，位于县城以东13公里，地处东经109°23′、北纬22°28′，大坝坐落佛子镇的大张垌、元眼山村之间。因水库在县城东部，故名灵东水库。工程于1957年进行勘测设计，1958年10月动工兴建，1961年枢纽主体工程基本建成。建设期间最高上场劳动力日达25000人。1961年，水库进行试蓄水，并发挥部分灌溉效益。1963年，全部完成主坝、放水涵管、溢洪道等枢纽工程。随着灌区工程的建成，逐年增加灌溉效益，1977年，灌溉效益达173000亩。水库枢纽工程建设期间，国务院总理周恩来到广东视察时曾询问灵东水库的施工情况，并指示工程建设要加强具体领导，认真抓好工程施工，确保工程安全，早日发挥效益。水库集雨面积145平方公里，总库容1.79亿立方米，有效库容7900万立方米。水库设计灌溉面积17.745万亩（包括灌区内的结瓜工程效益）。建有坝后水电站2座，装机5台1240千瓦。水库建成后，1963年12月31日，成立灵东水库管理局，编制80人；同时成立佛子、新圩、三海、檀圩、那隆、三隆、陆屋7个水利管理所。
牛皮鞑水库，是灵东水库南干渠的结瓜工程。位于佛子镇新塘村委会礼兴坡村，距佛子圩4公里，地处东经109°22′、北纬22°24′。该工程于1958年11月兴建。集雨面积11.45平方公里，主坝为均质土坝，坝高35.9米，坝顶长150米。总库容597万立方米，有效库容373万立方米。水库正常蓄水位时，淹没耕地面积240亩，溢洪道设在大坝右端，为闸式宽顶堰，堰宽为4.8米，最大泄洪流量为118.8立方米每秒，放水涵管分高涵管和低涵管。高涵管为H型闸门，涵管管径0.65米，放水流量为1立方米每秒。低涵管进口为斜拉板启闭，管身直径0.9米，放水流量为2.36立方米每秒，水库效益计入灵东水库灌区，水库归灵东水库管理局统一管理。
天顶山水库，位于檀圩镇东岸村委会天顶山村，故名天顶山水库，距檀圩5公里，地处东经109°11′、北纬22°18′。工程于1957年9月兴建，坝身为均质土坝，坝高14.5米，坝顶长220米，集雨而积4.5平方公里，总库容313万立方米，有效库容220.8万立方米。溢洪道设于大坝右侧一山坳，为宽顶堰，宽20米，底流消能，最大泄洪流量124立方米每秒。放水涵管设于大坝右端，梯级斜管放水，涵管为钢筋混凝土圆管，管内径0.8米，最大放水流量为0.5立方米每秒，水库达正常蓄水位时淹没耕地470亩。该水库属灵东水库南干渠的结瓜工程，归灵东水库管理局管理。效益纳入灵东灌区内。
桐油塘水库，位于那隆镇茶子村委会桐油塘村，故名桐油塘水库，距那隆圩7公里，地处东经09°07′、北纬22°17′。工程于1956年1月兴建，坝身为均质土坝，坝高20.5米，坝顶长160米，副坝2座共长36.5米。集雨而积5.28平方公里，总库容333万立方米，有效库容229.6万立方米。溢洪道设于主坝右侧一山坳处，为开敞式宽顶堰，宽18米，底流消能，最大泄洪流量为93.7立方米每秒。放水涵管设于主坝左端，为钢筋混凝士圆管，管内径0.7米，梯级斜管放水，最大流量0.82立方米每秒。水库达正常蓄水位时淹没耕地110亩。该水库是灵东水库南干渠的结瓜工程，效益计入灵东灌区，归灵东水库管理局统一管理。
龙塘水库，位于三隆镇大马村委会李屋塘村，距三隆圩6公里，地处东经109°00′、北纬22°20′。工程于1957年9月兴建，大坝为均质土坝，坝高15米，坝顶长115米，副坝2座共长146米。集雨面积6.29平方公里。总库容566万立方米，有效库容406万立方米。溢洪道设于主坝右侧一山坳，开敝式宽顶堰，堰宽25米，最大泄洪流量为75立方米每秒。放水涵管设于主坝左端，圆形钢筋混凝土管，管内径0.7米，梯级斜管放水，最大放水流量0.25立方米每秒，水库达正常蓄水位时淹没耕地1350亩。水库是灵东水库北干渠的结瓜工程，效益计入灵东灌区，归灵东水库管理局统一管理。
京塘水库，位于平吉镇平沙村公所京塘村背。属钦江流域平吉段水车江支流，拦截河流6.91公里。坝区集雨面积9.44平方公里，是一座以灌溉为主，兼发电、养殖综合利用的中型水库。总库容1116万立方米，有效库容700万立方米，死库容20万立方米。设计灌溉面积为1.8万亩，灌溉平吉、青塘2个乡镇13个村公所的农田。1959年1月动工兴建，次年主坝、副坝、放水管基本完成。主坝的坝型为均质土坝。坝顶高程58米，防浪墙高程59米，坝高24米，坝顶长107米，顶宽5.5米，正常水位54米，设计洪水位56.46米，校核洪水位57.46米，汛期控制水位50米，死水位42米。该水库原设计灌溉面积1.8万亩，水库建成后，把那拉、猪槽麓小（一）型及鸡窜塘、勒菜麓、那垌坝等小（二）型水库划归京塘灌区统一管理，总灌溉面积为21750亩。灌区总干渠长4公里，干渠长7公里。支渠有12条，全长50.2公里，渡槽14座，长346米。 钦江发源地白牛岭，为六万大山余脉东山山脉的山峰，六万大山延伸入灵山县东北部，在县内又形成罗阳山和东山两条山脉，山脉总的走向呈东北——西南走向。其中东山山脉，从平山镇北面起，绵延于钦江以北，是钦江水系与郁江水系的黔炉江、修竹江、平南江的分水岭。主要山峰有东山，海拔714.9米，位于平山、丰塘2镇之间，是县内最大的山岭。
上游灵山县境内地势东北高而西南低，东北部属高丘陵区（即低山），西北部属中丘陵区，中部低丘盆地相间，南部属低丘台地区。东北部高丘陵区，海拔一般为200～800米；中部钦江谷地，海拔一般为30～100米；南部低丘陵区，海拔一般为50～200米。
中下游位于钦州市境内，中游北部地区属低山区，位于钦州市北及东北部地区，有古道岭、尖岭、高卓山、母鸡顶等四条小山脉，从东北向西南平行而下，因而分割成沿茅岭江及沿钦江南下的两片带状的冲积平原，即板董平原及平吉九百垌平原。小山脉一般海拔高度在400—630米之间，以北部古道岭最高，海拔629米，高卓山次之，海拔535米，属低山地带。岩石以花岗岩、褐色或绿色砂页岩为多。
中游南部地区及下游为平原，北部为冲积平原，主要分布于中部、南部地区，较大冲积平原为钦江三角洲、板董平原及平吉九百垌平原。钦江三角洲位于市境南部钦江下游一带，由钦江冲积而成，为市内最大的冲积平原，也是钦州地区第二大三角洲。其顶部在市区东北角的沙坡，发育于钳状丘陵夹湾中，南北长10公里，东西宽13—14公里，面积135平方公里，平均海拔3米，河沙和海积淤泥交错分布，具明显海陆交错相。海湾深入三角洲内部，河道宽阔，水网密布，水土光热条件较好，是广西重要的粮蔗产区。九百垌平原位于平吉镇中部，沿钦江两岸成带状分布，面积约20平方公里，为钦州市第二大平原，平原区内土地肥沃，盛产水稻、甘蔗，是钦州市甘蔗基地之一。板董平原由茅岭江冲积而成，沿茅岭江两岸呈带状分布于板城、小董一带，面积约14平方公里，区内成土母质多为花岗岩，土壤最为肥沃，为市内主要的产粮区，素有“钦州谷仓”之称。此外，在东南部那彭附近的低丘地带间，还有面积不大的冲积小平原。
下游为滨海平原主要分布于南部沿海地区，面积较为广大，其中尤以沙埠、康熙岭南部和尖山最为宽广平坦，而犀牛脚南部尚有起伏山岗所分割，由于海浪侵蚀，已成为珊瑚地带。市内滨海平原的成土母质多为浅海沉积物，土壤瘠薄，以强酸性水稻土、沼泽化盐渍土及沙土为多，成为全市的粮食低产区。因受季风和地形影响，年内雨量分配极不均匀，滨海平原春季雨量较少，容易发生旱灾，夏季雨量较多，易发生涝灾和潮灾。
钦江最后注入茅尾海，其属钦州湾内一小海湾，位于钦州湾西海域最北部。海湾内宽口窄，呈椭圆形，东、西、北三面为陆地所包围。面积约135平方公里，大部分为干出滩。海内水较浅，一般水深0.1—5米。有钦江、茅岭江注入，江、海两水交融，咸度低，温度适中，水中浮游生物丰富，是浅水鱼类及贝类繁殖的良好场所。盛产牡蛎、鲈、鲻、鲷、黄鱼、青蟹等，尤以牡蛎著称。海湾的东南部和西部，分别是钦州海水养殖场、康熙岭蚝场，为市内近海渔业生产和海水养殖基地。此外，海湾内还生长有茂盛的菅草、水草和海榄树，盛产水鸭等野生水禽。一年四季，成千上万的野鸭、海鸥、沙螺鸠、蓑衣鹤在这里栖身出没。
河口形成三角洲海岸，其特征是海岸发育在河口湾内；汊道河床密布，岸线切割破碎，潮坪宽度大，特别是茅尾海沿岸，潮坪面积约占80%，潮滩宽5—7公里，坡度<1‰；海成砂堤发育，岸线向海淤进明显，有利于围海造田，岸外均有人工堤保护。 流域上游地区在灵山县，地处低纬度，属南亚热带季风气候。一年中气候温和，夏长冬短，雨量充沛，光照充足，冬春季有间歇性寒潮入侵。据县气象站1956～1984年记录，年平均气温21.7℃，极端最高气温38.2℃（1957年8月15日），极端最低气温一0.2℃（1963年1月15日）。年积温7500～8100℃，无霜期平均为348天，年平均有霜日数仅2.5天。年日照总时数在1400～1950小时，平均为1673小时。年降水量最大年份为2438毫米（1961年），最小年份为1005毫米（1963年），平均为1658毫米，多集中在4～9月，这期间降水量占全年的80%，年平均降水日数161天。
钦州市位于北回归线以南，在著名的亚洲东南部季风区内，太阳幅射强，季风环流明显。由于南临北部湾，西北靠十万大山，主要受海洋气候影响，也受大陆气团影响，海洋性气候明显，是湿热多雨的地方之一。
