专精特新和小巨人区别是：概念不同、奖补不同、认定标准不同。
1、概念不同
专精特新是2013年7月工信部发布的，正式提出发展专精特新类中小企业，即促进中小企业走“专业化、精细化、特色化、新颖化”发展之路。专精特新小巨人是在专精特新范围内，进一步开展小巨人的认定。
2、奖补不同
专精特新和专精特新小巨人每户给予一次性的奖补虽然主要以各地方具体奖补金额为准，但是小巨人的要比专精特新的奖励多一些。
3、认定标准不同
专精特新是原则上注册并经营两年以上，具有独立法人资格，符合国家中、小、微型企业划分标准，拥有“专精特新”产品（技术）并生产经营状况良好。
品（技术）符合国家标准，特殊行业的要符合国家相关规定，新产品（技术）须经过专门机构认定，有合法有效的注册商标且进入市场（技术运用）一年以上且符合国家产业政策、技术政策和相关行业政策。在市场、质量、效益或发展等方面处于同行业领先水平，具备先进性和示范性。
专精特新小巨人企业主导产品应优先聚焦制造业短板弱项，符合《工业“四基”发展目录》所列重点领域，或符合制造强国战略十大重点产业领域，或属于产业链供应链关键环节及关键领域“补短板”“锻长板”“填空白”产品，或围绕重点产业链开展关键基础技术和产品的产业化攻关，或属于新一代信息技术与实体经济深度融合的创新产品。
专精特新小巨人的基本条件
1、在中华人民共和国境内工商注册登记、连续经营3年以上、具有独立法人资格、符合《中小企业划型标准规定》的中小企业，且属于省级中小企业主管部门认定或重点培育的专精特新中小企业或其他创新能力强、市场竞争优势突出的中小企业。
2、坚持专业化发展战略，长期专注并深耕于产业链某一环节或某一产品，能为大企业、大项目提供关键零部件、元器件和配套产品，或直接面向市场并具有竞争优势的自有品牌产品。
3、具有持续创新能力和研发投入，具有一定的示范推广价值。
4、重视并实施长期发展战略，具备发展成为相关领域国际知名企业的潜力。
以上内容参考百度百科-专精特新“小巨人”企业认定与培育办法