中国社会科学院研究生院拥有多个特色鲜明的部系，致力于提供全面的学术研究与教育。首先，哲学教学研究部设有马克思主义研究系，深入探讨哲学理论及其在社会中的应用。世界宗教研究系则专注于全球宗教研究，增进对多元文化的理解。
在经济学教学研究部，经济系涵盖了工业经济、农村发展、财政与贸易经济等多个领域，为学生提供扎实的经济基础。数量经济与技术经济系和城乡建设经济系则关注现代经济技术和城乡规划的研究。投资经济系和城市发展研究系针对经济发展趋势和城市规划展开研究，人口与劳动经济系和政府政策与公共管理系则聚焦政策制定与社会管理的实践。
法学教学研究部的法学系与政治学、社会学、民族学等专业相互补充，培养法学人才。文学教学研究部则包括文学系、少数民族文学系、外国文学系，以及新闻学与传播学系和语言学相关领域，致力于文学创作、传播与语言研究。
历史学教学研究部设有历史系，探索中国近代史、世界历史、考古学以及国史和边疆历史的研究。国际问题教学研究部则关注世界经济与政治，设有美国研究、欧洲研究、俄罗斯东欧中亚研究等多个研究方向，以及针对亚洲、西亚、非洲和拉丁美洲的专门研究系。
中国社会科学院研究生院成立于1978年，是经邓小平、叶剑英亲自批准设立的直属于我国人文社会科学研究最高学术机构和综合研究中心——中国社会科学院——的研究生培养基地，也是我国第一所研究生院。其主要任务是培养人文和哲学社会科学各学科博士研究生和硕士研究生。经过近30年的实践，研究生院已初步形成了从招生录取到研究生教育和培养、学位授予以及海外留学研究生、成人继续教育和同等学历申请学位等一整套研究生教育和培养体制机制，建立起了适合于中国社会科学院特点的“集中办院、按所设系、分片教学、统一管理”的办学模式。