南通大学和常州大学比南通大学好。南通大学的师资力量更深厚、教学设施更完善、学科建设更齐全。
一、师资力量
1、南通大学：南通大学有教职工3152人，其中高级职称以上1549人，博士、硕士生导师1300余人。共有两院院士10人（含双聘院士9人），国家万人计划领军人才2人，国家杰出青年科学基金获得者2人，国家优秀青年科学基金获得者1人，“百千万人才工程”国家级人选3人。
“973”项目首席科学家2人，国家重点研发计划项目首席科学家4人，奥运会冠军1人，江苏省“333”高层次人才第一层次1人，第二层次10人，江苏省特聘教授17人。师资力量更深厚。
2、常州大学：常州大学有教职工近1800人，其中专任教师1250余人，硕士及以上学位教师占比95%（博士学位56%）；高级专业技术职务629人。拥有工程院院士4人（双聘），国家“万人计划”教学名师1人，国家杰出青年科学基金获得者1人。
“新世纪百千万人才工程”国家级人选3人，教育部新世纪优秀人才支持计划3人，享受国务院政府特殊津贴专家12人；学校现有江苏省“双创人才”、“333工程”、“特聘教授”、“青蓝工程”等省级人才140余人。师资力量更缺乏。
二、教学设施
1、南通大学：南通大学占地面积3700余亩，建筑面积近100万平方米，拥有高标准配置的教室、计算机网络教室、多媒体教室、新型语言实验室、理化生史地实验室、生物标本室、通用技术实验室、劳动技术实验室、美术室、音乐室、形体健身房、全塑胶运动场等。教学设施更完善。
2、常州大学：常州大学占地面积2498亩，建筑面积71万平方米。有体育馆、艺术馆、实验楼、饭堂、学生公寓等设施。所有的教室均配置了电脑、高科技触屏黑板、投影仪等多媒体设备，学生公寓八人一间，并配备了空调。教学设施更缺乏。
三、学科建设
1、南通大学：南通大学有有3个一级学科博士学位授权点，二级学科博士学位授权点有20余个，17个一级学科硕士学位授权点和105个二级学科硕士学位授权点。拥有1个江苏省高校国家重点学科培育建设点，6个江苏省一级学科重点学科，3个江苏省一级学科重点建设学科。学科建设更齐全。
2、常州大学：常州大学有1个一级学科博士学位授权点、13个一级学科硕士学位授权点、3个专业学位类别授予点、9个专业学位授权领域。拥有2个省优势学科、7个省“十三五”重点学科。学科建设更缺乏。
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