第1个回答 2022-10-07
NONCODE DB是一款综合性的数据库，该数据库是一个比较全面的ncRNA相关注释的数据库，尤其是lncRNA信息，不仅支持常用lncRNA的name、NONCODE ID（例如：NONHSAG000001）搜索，部分lncRNA支持其他数据库名字进行搜索。
该数据库目前收入了16个物种，主要是动物方面的，包括人、小鼠、大鼠、奶牛、鸡、果蝇、斑马鱼、线虫、酵母、拟南芥、黑猩猩、大猩猩、恒河猴、复鼠、鸭嘴兽、猩猩。
数据库包含信息丰富，包括表达、功能、与疾病关系、染色体位置、序列保守性等，并可进行序列Blast搜索，同时支持数据下载。目前最新更新为2017年4月6日更新的版本。
数据库的使用
基于这个数据库我们可以浏览所涉及物种的全部lncRNA信息，搜索感兴趣的lncRNA，功能查看，比对，下载等。
1）已知某lncRNA 的序列信息，想知道该lncRNA基因组上位置信息，功能如何？
只需要将序列信息粘贴到blast模块，（参数默认）
2）对于刚刚搜索的比较感兴趣的lncRNA进行功能的注释如下：
只需将lncRNA 的基因ID 输入到Function模块即可。
3）lncRNA的保守性分析：
在concervation模块中输入基因ID即可得到保守性分析树，