唇腭裂的治疗一般是遵循序列治疗的原则，从患者出生到成人，期间需要根据患者唇腭裂程度进行相应的手术，并不是说以下所有手术都需要做，需要根据唇腭裂医师团队评估之后，制定相应的手术方案。
1.唇腭裂新生儿出生后
护理团队根据患儿唇腭裂情况，指导新生儿母亲正确的喂养方式、姿势及特制奶瓶的使用。
社会工作者及心理医生介入疏导唇腭裂患儿家属情绪，帮助其正确面对未来治疗。
2.患儿生后1个月
唇腭裂医生专家商讨是否对患儿进行上唇胶带粘贴拉拢治疗或鼻齿槽矫治器治疗，一般自出生后1个月后开始，为期1-3个月至唇裂术前。
3.患儿生后3-6个月
唇腭裂医生行一期唇裂修复术。
4.唇裂修复术拆线后一周
佩戴鼻翼支撑架，建议半年到一年以上。
5.患儿生后9-18个月
唇腭裂医生行一期腭裂修复术。
6.患儿3.5岁
语音治疗师对患儿进行语音评估及语音矫正治疗，一般为期2个月到1年即有明显改善。
7.患儿4-5岁
如语音矫正效果不明显，唇腭裂医生在宝宝上幼儿园前行腭咽闭合不全矫正术。
8.患儿4-6岁
唇腭裂医生给予乳牙期上颌后缩、反牙合、错牙合等的口腔正畸矫正，也为后期齿槽植骨做准备。
9.患儿7-9岁
小学前，唇腭裂医生针对患儿心理可酌情行唇鼻继发畸形矫正术，裂侧面中部及唇部自体脂肪填充术改善患儿面容及心态。
10.患儿8-12岁
有的医生主张早期行槽齿嵴裂修复术（自体骨移植或BMP植入）；也有主张稍晚施行，待尖牙牙根萌出2/3时再做。（8-12岁混合牙列期是最适合年龄，大部分患者的尖牙可以从植骨区正常萌出。）
11.患儿6-13岁
唇腭裂医生给予替牙期口腔正畸，需在齿槽嵴植骨术后3-6个月，裂隙骨组织完成改建、吸收、恢复后进行。一般于3个月后进行，目的是通过尖牙萌出的功能刺激及植骨后扩弓等正畸治疗手段减少移植骨吸收。
12.患儿13-16岁
恒牙期口腔正颌&正畸联合治疗，包括：局部矫牙，排齐牙列、反牙合、错牙合矫治，前方面具牵引治疗，正畸治疗后修复失牙等。
13.患儿17岁以后
唇腭裂医生最终评估行唇继修复术及正颌手术。