广西壮族自治区民政厅根据其职责设有多个关键部门，以确保民政工作的高效运行。
(一) 办公室: 负责机关的文电处理、会议安排、机要事务、档案管理、信访工作、政务公开、督查督办、政务协调、安全保密，以及民政宣传和信息管理工作。
(二) 法制处: 主要负责起草民政地方法规、政府规章，审核机关文件的合法性，进行行政复议和应诉，进行法制理论研究、调研，并负责法制普及教育。
(三) 民间组织管理局（行政审批办公室）: 管理社会团体、民办非企业单位和基金会，指导和监督相关登记管理及执法监察，包括全国性社会团体在广西的日常管理工作，负责行政审批事项。
(四) 优抚处（自治区拥军优属拥政爱民工作领导小组办公室）: 组织拥军优属活动，管理军烈属优待工作，制定并实施各类优抚对象的待遇标准，负责伤残军人的抚恤和伤残辅助器械配置等事务。
(五) 退伍军人和军队离退休干部安置办公室: 制定安置计划，接收安置军队退休人员，管理退役士兵职业技能培训和就业，指导军休服务机构和军供站工作。
(十三) 人事处（社会工作处）: 负责机关和直属单位的人事工作、机构编制，以及社会工作发展规划和人才队伍的建设。
机关的党群工作由机关党委负责，离退休人员工作则由离退休人员工作处管理。