1．中学教育研究室：主要从事中学教育的研究和指导。
2．小学教育研究室：主要从事小学教育的研究和指导。
3.国学研究室：负责指导组织全市中小学幼儿园开展国学经典诵读活动，研究国学经典诵读过程中的难点、热点问题，总结提升我市中小学、幼儿园国学经典诵读活动的经验并加以宣传推广。
4．教育理论研究室：主要从事全市基础教育教育科研的规划、管理和指导工作、以及中小学心理健康教育、学前教育研究和指导工作。
5．职业教育与成人教育研究室：主要从事中等职业技术学校的教学研究和指导以及劳动力转移培训、社区建设、成人中专教学的研究和指导。
6．藏区“9+3”免费教育项目教学研究室：主要从事“9+3”免费职业教育教学研究、教学管理、教学指导、师资培训、指导和参与教改实验等工作。
7．教育发展研究中心：主要从事教育的中宏观研究，为成都教育发展提供决策咨询。
8．教师发展中心：主要从事全市教师队伍的继续教育以及继续教育学时的管理工作；对全市教师专业发展承担管理、评估、研究、指导、培训和服务的工作。
9.成都市基础教育质量监测中心:
(1).拟订成都市基础教育学业质量评价标准。包括小学、初中和普通高中各学科学业质量评价标准和身心健康状况等相关领域的指标体系。研制成都市中小学学生学业质量生态指标体系；
(2).研究开发成都市基础教育学业质量监测工具。包括小学、初中、高中各学段各学科基于课程标准的学业质量测试（含调研、诊断等）工具；
(3).受市教育局委托具体实施成都市基础教育学业质量监测工作。拟订监测实施方案，组织实施监测工作，对监测数据进行处理、分析，向市教育局报送监测报告；
(4).为各区（市）县开展基础教育学业质量监测工作提供技术支持和业务指导。
10.成都市国际教育政策与课程研究中心:
(1).负责对国际教育形势和政策的发展动态进行研究，为成都市教育国际化提供政策咨询；
(2).对国外课程的发展动态和课程设置进行分析研究：研究借鉴欧美等发达国家和地区高中合作办学的经验，为我市普通学校、职业学校教育国际课程设置搭建工作平台，提供相关的建议和意见；
(3).研究国际理解教育的发展动态，组织开展全市国际理解教育教研活动；负责国际理解教育之全市大校本国际课程（地方课程）的研究、开发、开设大校本教材，为全市中小学生增强国际视野，更加有效地参与国际交流和合作提供课程支持；
(4).开展比较文化研究，开设地方文化课程并编写教材，为在蓉留学生和其他外国人士了解成都地方文化提供教学服务；
(5).对全市设立的国际学校和国外课程班的规教学进行视导与监管；组织开展全市国外课程班级教研活动，并对开设课程、使用的教材进行分析和研究；
(6).组织承担课程类国际学术会议。
11．行政办公室（党委办公室）：主要从事内部管理以及为本院教研、科研、师资培训服务和全院党务等工作。
成都市教育学会秘书处、成都市职业技术教育学会秘书处、成都市成人教育协会秘书处、成都市地理学会挂靠在成都市教育科学研究院。
成都市教育局设立在成都市教育科学研究院的管理机构有：成都市教育科学规划领导小组办公室、成都市基础教育课程改革领导小组办公室、成都市教育局普通高中课程改革工作办公室、成都市心理健康教育指导委员会办公室、市德育工作小组办公室、成都市中小学教师教育领导小组办公室和成都市国学经典诵读指导中心。
