新疆维吾尔自治区人民政府管辖下，分布着多个地州市，它们各自代表着自治区内的不同行政区域。首府乌鲁木齐市，位于自治区东部，是自治区的政治、经济中心。伊犁哈萨克自治州位于北部，拥有独特的哈萨克族文化特色。塔城地区和阿勒泰地区则坐落在西部，自然风光秀美，是边疆的重要组成部分。博尔塔拉蒙古自治州坐落在西部，以其丰富的畜牧业和草原景观闻名。
昌吉回族自治州位于中部，拥有悠久的历史和多元的民族风情。吐鲁番地区和哈密地区则以炽热的沙漠和葡萄园著名，是新疆的农业重地。巴音郭勒蒙古自治州则以其草原和牧业文化著称。阿克苏地区和克孜勒苏柯尔克孜自治州位于南疆，拥有丰富的自然资源和多元的民族风情。
喀什地区和和田地区位于南疆的西部，拥有独特的边疆特色和丰富的历史文化。克拉玛依市和石河子市作为现代化城市，展现了自治区的工业发展实力。阿拉尔市、图木舒克市、五家渠市以及北屯市等，是兵团系统的驻地，主要负责农业生产和建设任务。
新疆生产建设兵团下设多个农师和建工师，如农一师阿拉尔市、农二师至农十四师等，它们在兵团的经济发展和建设中发挥着重要作用。这些地州市和兵团机构共同构建了新疆自治区的多样性和繁荣。
新疆维吾尔自治区人民政府是中华人民共和国新疆维吾尔自治区的国家行政管理机关。自治区政府办公地址位于乌鲁木齐市中山路479号。