第1个回答 2024-10-19
在数据分析和可视化领域，处理多组样本时，维恩图经常面临展示能力与可读性不足的问题。集合图（Upset plot）作为维恩图的进阶版本，能更有效地展现大量分组信息。
集合图由三部分构成：顶部柱状图显示交集大小；左侧条形图表示各集合规模；右侧矩阵显示集合间交集情况。若两个样本间有相同元素，通过连线表示；多个样本间连线则代表这几组样本内的共有元素。
接下来，让我们用R语言来绘制集合图。以示例数据（data1.csv）为例，数据为丰度/表达量矩阵，应包含表头与列名，每列代表样本，每行对应指标数据，如OTU、基因ID、代谢物等。
示例代码流程如下：读取数据、加载R包、将丰度矩阵中的非0值转换为1，使用R绘制集合图并进行美化。调整条形图颜色、高亮显示特定交集。通过queries参数定制显示的交集，设置color与active字段来控制显示样式与颜色。
通过上述步骤，我们可以轻松地利用R语言绘制出美观且信息丰富的集合图，为数据分析提供直观的视觉辅助。