入境检验检疫局和海关这两个部门是没有业务方面的交叉的。两者的区别有:
入境检验检疫局简称C.I.Q,是为国家进行出入境检验检疫工作的部门。主要的职责包括有对出入境的货物、人员、交通工具、集装箱、行李邮包携带物等进行包括卫生检疫、动植物检疫、商品检验等的检查,以保障人员、动植物安全卫生和商品的质量。
海关则是依据本国(或地区)的法律、行政法规行使进出口监督管理职权的国家行政机关。是对出入国境的一切商品和物品进行监督、检查并照章征收关税的国家机关。
可以参考关于中华人民共和国北京海关概况资料,网页链接