高烧39℃如果不进行特殊处理，有的时候会造成热性惊厥，所以还是有一定危险性。因为孩子本身相对年龄比较小，在高热39℃的时候容易造成脑神经细胞的异常放电，出现热性惊厥的情况，反复惊厥对神经系统也是损伤，同时在高热的时候可能会出现脱水的情况，造成电解质紊乱，再有就是高热的时候会让呼吸、心率都增快，对机体也是有一些损伤。
发热引起的病因不同，所以对身体的损伤程度也会有差异，像有些病毒感染、幼儿急疹的时候，虽然发烧39℃，但是一般状态很好，除了适当的进行对症的控制体温以外，一般三天左右就能够缓解，这种疾病本身没有危险，但是也有一些孩子的发烧引起的原因就相对比较严重。如果反复控制不住可能会造成全身机体的感染加重，可能会引起更加明显的机体损伤，这个时候的疾病就有危险。所以发热39℃是否有危险，主要取决于引起发热的病因是什么以及孩子自身的机体状态。
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