青州市河流分属弥河、
小清河两大水系，过境河流有弥河、淄河两条。庙子、
邵庄大部属于小清河水系淄河流域，主要河道有淄河及其支流仁河。普通、东高、高柳、朱良、何官、口埠、王母宫办事处属小清河水系，其河道多为平原排水河道，主要北阳河、裙带河、王饮河、乌阳河、龙泉河、富龙河、跃龙河等七条河流。
东部地区属弥河水系，主要有大石河、小石河、南阳河、洗耳河、康浪河、尧河等六条。
青州的水库：西门水库、东南河水库、钓鱼台水库、仁和水库、黑虎山水库、琵琶水库。
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