孔村镇位于东经116°15′--116°37′，北纬36°00′--36°25′之间，平阴县东南部，距县政府17公里 。东与肥城市石横镇相接，靠近肥城矿区；北与平阴镇交界，西与东阿镇接壤，南与孝直镇相连。毗邻泰聊公路，国道105线和济菏高速贯穿南北，正在规划设计中的泰聊铁路、青兰高速穿越东西全境，交通便利，区位优越。
镇东部地势西高东低，土壤为沙壤土，土地深厚肥沃；镇西部属纯山区，土壤类型为褐土类中壤土，岩层分布主要是表层为石灰岩，150米以上为张夏灰岩，PH值7.3-7.5，有机质含量0.8-1.2%。地势南高北低，东高西低，土质较为疏松，耕性良好，适于各种作物生长发育 。
属暖带半湿润区的大陆性季风气候区，其特征是：气候温和，四季分明，冬季寒冷少雨雪，春季干旱多风，夏季炎热多雨，秋高气爽温差大，有利于作物的生长发育。全年平均气温13.6℃，7月份最高平均27.4℃，1月份最低平均为-1.4℃，无霜期180天，夜间凉爽，昼夜温差大，有利各种作物的养分积累。
光照资源丰富，日照时数长，光照充足，有利于作物光合作用。常年平均日照时数为2392小时，占全年可照射时数的54%，常年以五月份日照时数最多，平均269.44小时，十二月份最少为164.4小时。降雨量偏少，且多集中在盛夏季节，年际变化大，年平均降水量643毫米，春季降雨偏少，常年降水量仅在80毫米左右，是年降水量的13.3%，降雨量少，不利于各种农作物病早害的传播流行，有利于干杂果花的生长。一般地下水在40米左右，地下水PH值属中性，比较适应人畜及浇灌农田，西部山区水质清澈，矿物质含量丰富，无任何污染，生物种类丰富，农、林、果、菜生产良好，经济林木有葡萄、苹果、梨、核桃等十几种，林木有杨、槐、桐、柳等几十种，饲养牲畜有牛、羊、鸡、猪等野生资源丰富非常适宜居住。
