2001年，武汉慧正计算机系统工程有限公司设立环保事业部，涉足环境自动监控业务，同年5月，协助湖北省环保局组织西安长天环境监控软件及适配器（国家标准软件）全省培训班；8月在武汉阳逻电厂开展污染源自动监控系统建设试点；10月，协助省环保局承建全省重点工业企业污染源自动监控系统建设工作会议。
2002年，在全省开展重点工业企业污染源自动监控业务，同年9月在环保事业部的基础上设立武汉慧正环保工程有限公司；12月在全省100家企业污染源自动监控系统项目建设招标中，武汉慧正环保工程有限公司成为四家中标单位之一，负责宜昌市、荆门市、鄂州市、潜江市污染源自动监控系统项目建设。
2003年，承接宜昌市、荆门市、鄂州市、潜江市污染源自动监控系统项目建设，组织开发环境监控软件与适配器；同年12月，中标湖北省环保局环境监控软件与适配器招标采购项目并在全省安装。
2004年，武汉慧正环保工程有限公司业务区域由宜昌等四市逐级向全省扩展，营业额不断增加。
2005年，武汉慧正环保工程有限公司业务区域不断扩大，营业额不断增加。
2006年，武汉慧正环保工程有限公司业务区域基本覆盖全省，开始涉足环境水质自动站业务，承建荆门漳河水库水质自动站；同年3月，设立湖南慧正环境科技发展有限公司，在湖南相关地市开展污染源自动监控系统业务；10月与广州怡文科技有限公司合作，中标九江市污染源自动监控信息化平台及系统建设与运营项目
2007年，武汉慧正公司继续扩大业务范围、增加业绩，湖南慧正公司逐渐成长，业务量逐渐提高。同年3月，设立江西怡正环保科技有限公司，全面负责九江项目的实施。公司创始人周发武主编出版《环境自动监控系统技术与管理》，并被聘为中国地质大学（武汉）兼职教授。
2008年，武汉慧正、湖南慧正、江西怡正等公司在湖北、湖南、江西扩大经营范围和业务领域。同年12月，湖南慧正中标湖南省污染源自动监控系统建设与五年专业化运营项目，负责张家界、怀化、湘西、邵阳等地区的项目建设与运营。公司创始人周发武获中国环境优秀科技工作者称号。8月，设立宜昌慧正环保工程有限公司，承担宜昌市污染源自动监控系统专业化运营。
2009年，公司创始人周发武承担黑龙江省科技厅污染源自动监控系统监测体系与管理体系研究课题。设立武汉巨正环保信息技术有限公司从事环境监控系统软、硬件产品开发。武汉慧正、湖南慧正、江西怡正、宜昌慧正也不断发展，营业收入不断提高。
2010年，各公司业务快速发展。公司创始人周发武与中国地质大学鲍建国教授合著出版《清洁生产实用教程》。12月底，引进风险投资机构，武汉慧正环保工程、湖南慧正环保科技、江西怡正环保科技、宜昌慧正环保工作、武汉巨正环保信息技术五家公司重组，武汉巨正环保信息技术有限公司增资并更名为武汉巨正环保科技有限公司，其他公司或变更为子公司或业务剥离。
2011年，公司发展实现历史性与战略性突破。同年7月，公司办公地由原华银大厦迁至武汉东湖新技术开发区“光谷总部国际”新址，拥有自主房产办公面积1600平方米、租用研发与生产面积800平方米；公司董事长周发武与公司云计算研究院院长杨正洪合著出版《云计算和物联网》；8月，公司被湖北省上市办列为省后备上市重点企业；公司有多项基于物联网与云计算技术的项目上报国家科技部、环保部、省科技厅、省环保厅、武汉市环保局及及东湖新技术开发区。目前公司各类资质齐全，已有包括一大批博士、硕士、学士及专家教授组成的优秀团体，员工增至300人。公司拥有环保云计算、环保物联网、各类环境监控专业设备、传感器、各类环保应用软件等核心技术和产品，为公司业务转型及向全国范围拓展奠定了坚实的基础，营业收入不断攀登新高。
