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16s菌种鉴定
16S
rDNA
鉴定
为什么选用16SrDNA进行细菌鉴定?
答:
最关键的是,
16S
rDNA的恒定区序列具有高度保守性,而可变区序列则因细菌种类而异。利用恒定区设计引物,可以扩增出16S rDNA片段,再通过分析可变区序列的差异,实现对不同菌属、菌种细菌的精确分类和
鉴定
。这一过程在细菌鉴定中扮演了至关重要的角色。
细菌
鉴定
中到底是
16s
rDNA测序还是16srRNA测序?
答:
16s
rDNA测序包括细菌基因组DNA提取、
16S
rDNA特异引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。是一种快速获得细菌种属信息的方法。英文名称是16S ribosomal DNA identification,应用有细菌种属
鉴定
。
菌种鉴定
测部分序列还是全序列
答:
16s
rRNA长度为1.5k多,作为
菌种鉴定
一般选择相似度97%的标准,相似度超过97%一般定义为同一种菌。如果是sanger测序获得16s全长的都可以鉴定到种,甚至能区分亚种。有些细菌并不只有1个16s序列,会包含有1-15拷贝的16s序列,所以单一的16s序列鉴定可能会出现偏差。利用高通量如454或miseq测序一般由于读...
16s
rdna和16srrna在
菌种鉴定
中的区别
答:
其中5S rDNA太短信息量不足,;
16S
rDNA一般有1.5 kbp够长了;而23S rDNA太长不便分析;所以一般我们都是以16S rDNA作为
菌株鉴定
的分析对象
求助:细菌
16s
rDNA
鉴定
时PCR通用引物
答:
。随着PCR技术的出现及核酸研究技术的不断完善,
16S
rRNA基因检测技术已成为病原菌检测和。通用引物1492r/F27,pcr后去测序,因为测序软件的自身原因,测出来开头的序列是杂带不准确,如果需要16sRNA的全长,必须做TA克隆,就需要载体的问题了。如果你要求
鉴定菌种
只到属,完全可以用通用引物。
16S
rDNA
鉴定
的鉴定步骤
答:
1、细菌基因组提取2、特异引物扩增
16S
rDNA序列3、纯化PCR产物4、DNA测序获得16SrDNA序列5、与数据库中已知细菌比较获得样品种属信息6、选取近似
菌种
序列,构建系统发育树
16S
rDNA
鉴定
的不足
答:
1、有的
菌种
由于种间差异小,单独依靠
16S
rDNA
鉴定
不能鉴定到种。需要其它鉴定方法补充。2、16SrDNA鉴定是基于PCR的鉴定方法,与其它PCR鉴定方法一样存在容易污染,获得假阳性结果,应注意做好阴性对照。
请教:细菌
16s
rDNA
鉴定
时PCR通用引物
答:
细菌
16s
rDNA
鉴定
时PCR通用引物 首先你要提出细菌的DNA。方法如下:1、液体培养及保种:从斜面上挑取菌苔于液体培养基中放摇床上震荡(转速160r/min)培养16小时。吸取菌液于1.5ml的经过灭菌的EP管中,再加甘油(30-40%)进行保种。(-80摄氏度保藏2年)2、提取DNA(CTAB法):(1)取1.5ml菌液...
...知道一株细菌的
16s
DNA的同源序列,进行
鉴定菌种
,请问如何查找啊_百 ...
答:
不是很明白你的问题。你想要
鉴定
这个细菌的话,可以直接对
16s
测序(或者你已经有序列了?),然后blast一下。如果你已经知道了这株细菌的可能种名,可以在ncbi上搜几个同属的序列出来比较一下。
菌种鉴定
方法
答:
菌种鉴定
的方法一般有常规鉴定和分子生物学方法:(1)常规鉴定:菌落形态观察、革兰氏染色、菌毛染色、糖类分解实验、吲哚实验、淀粉水解实验、V-P实验、甲基红实验、柠檬酸盐利用实验、硝酸盐还原实验、接触酶实验等 (2)分子生物学方法:细菌
16S
rDNA菌种鉴定:提取DNA,特定引物PCR扩增,PCR产物纯化测序...
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