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已知基因序列怎么设计引物
已知
动物PRL
基因序列如何设计引物
已解决
答:
2,
上游引物设计:选取正向5’-3’的基因序列约23bp左右
,copy下来;在这段序列的5’端加上你的上游酶切位点(一般6bp),再在之前加入两个任意碱基作为保护碱基;序列为:保护碱基(2bp)+上游酶切位点(6bp)+基因起始序列5’-3’,引物碱基总长约28-30bp.3,下游引物设计:将序列反相互补,得到...
已知
目的
基因
全长,
如何设计引物
克隆全长
答:
引物
17-20bp。 一般从你的靶
序列
2外侧100-200bp序列中产生。
请问有知道
如何
获取某一蛋白的
基因序列
以及如何构建其
引物
答:
1 到公用数据库(NCBI 等)搜索该蛋白/基因,看有没有登陆信息;2
如果数据库里没有该基因需要你自己用同源克隆方法来克隆该基因
;3 拿到基因序列后,
可以用专业的软件来设计引物
,如Primer Premier等,也可以到一些网站上设计,如NCBI
高中 通过
DNA
单链
怎么
写出
引物序列
答:
5'段的直接复制下来就OK,3'端需反向互补
,比如以你这序列前后各8bp位例,你的引物分别为:F: TACGCACA R: GTGCGATG 另外核酸序列的书写顺序默认都是从5'端到3'端的
基因
定位
如何设计引物
答:
如果是已经测序全
基因
组的物种,找这两个标记在染色体上的位置,然后下载其间的
序列
,一段一段做blast,找同源物种(或亚种)之间有indel的区段
设计引物
,包含indel在里面,长度为90-200bp之间都可以,我一般用110bp左右。如果初步定位区段比较大,可以隔500kb一个标记先再确定一下。如果是做大群体定的...
...前提是要有一段
已知
目的
基因
的核苷酸
序列
,但
引物
不是要两端的两段...
答:
获取目的
基因
,要知道转录版本全长,然后
设计
上下游
引物
。检测目的基因表达,只要设计上下游引物,扩增基因的100--200个碱基就可以了。或者你的提问本身有问题,基因碱基是互补的,知道一条,就可以设计上下游引物。
如何设计基因
cds
序列
的pcr
引物
答:
设计基因
CDS区的PCR引物是基因克隆和转染实验中的关键技术。首先,从细胞中提取总RNA,通过反转录将其转化为cDNA模板。对于目标基因如MYOD1,关键步骤是定位其mRNA和CDS
序列
。在NCBI等数据库中找到CDS部分,将其完整复制到PCR
引物设计
工具,如Primer 5.0中。正向引物应从CDS的起始核苷酸开始,通常选择18bp...
如何
进行
引物设计
?
答:
1、网址
引物设计
和验证的推荐网站为:Primer-Blast。这是一个专门设计用于在
已知序列
上设计引物或探针的工具。使用BLAST-Primer,您可以输入一个序列或一组序列,并为这些
序列设计引物
或探针,以便用于PCR扩增或杂交检测等分子生物学实验。需要注意的是,NCBI还有一个网站叫:BLAST。注意二者不要弄混。BLAST...
测序
引物怎么设计
答:
假设我们要设计一对针对人类
基因
组某特定区域的测序引物。首先,我们可以在数据库中找到该区域的
序列
信息,然后根据上述原则设计一对长度为20个碱基、GC含量约为50%的引物。接着,我们可以利用
引物设计
软件检查这对引物是否存在内部二级结构或引物间的互补情况。最后,将设计好的引物送到实验室进行PCR扩增和...
如何设计
pcr
引物
答:
2、
引物设计
需要注意的地方很多,在大多数情况下,我们都是在知道
已知
模板序列时进行PCR扩增的。设计的目的是在两个目标间取得平衡:扩增特异性和扩增效率。3、PCR引物设计的11条黄金法则引物最好在模板cDNA的保守区内设计。
DNA序列
的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。4、可以使用oligo6或者primer5...
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