工资的区别。四级主任科员和三级主任科员都是公务员的一种职级，而且都属于副科级，两者主要在工资待遇上有区别，在政治待遇和工作待遇上基本没区别。三级主任科员比四级主任科员工资上高3—500元之间吧。每两年调工资的“二年晋档”，每“五年晋级”比四级主任科员稍微高一点。每两年的工资调标，三级主任科员会比四级主任科员基数稍微多点。因为工资调标就是按照级别来的，级别越高工资调的越多。晋升二级主任科员，必须在三级主任科员两年以上，才能晋升。四级主任科员人满两年或者三年或者四年，想晋升到二级主任科员必须经历三级主任科员任职2年以上，并不是四级主任科员四年以上就可以直接任二级主任科员。
公务员的职级只在厅局级以下设置，一共是四等十二级。最低的一等为科员级，对应二级科员、一级科员；其次则为科级，对应一至四级主任科员，其中四级、三级主任科员为副科级，二级、一级主任科员为正科级；接下来就是处级，对应一至四级调研员；最高的为厅级，对应二级、一级巡视员。，四级主任科员和三级主任科员都属于副科级，但他们主要享受的是副科级工资待遇，而不享受副科级的政治待遇和工作待遇。他们所做的工作基本上也是与科员级一样的，没有领导职责，不享受领导待遇。这与乡科级副职是不同的，乡科级副职不仅享受副科级的工资待遇，也享受相应的政治待遇和工作待遇。
法律依据：
《中华人民共和国公务员法》
第十九条 公务员职级在厅局级以下设置。综合管理类公务员职级序列分为：一级巡视员、二级巡视员、一级调研员、二级调研员、三级调研员、四级调研员、一级主任科员、二级主任科员、三级主任科员、四级主任科员、一级科员、二级科员。
综合管理类以外其他职位类别公务员的职级序列，根据本法由国家另行规定。
第二十一条 公务员的领导职务、职级应当对应相应的级别。公务员领导职务、职级与级别的对应关系，由国家规定。根据工作需要和领导职务与职级的对应关系，公务员担任的领导职务和职级可以互相转任、兼任；符合规定资格条件的，可以晋升领导职务或者职级。公务员的级别根据所任领导职务、职级及其德才表现、工作实绩和资历确定。公务员在同一领导职务、职级上，可以按照国家规定晋升级别。公务员的领导职务、职级与级别是确定公务员工资以及其他待遇的依据。
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考